Con el título "Fernando de los Ríos y su tiempo" se celebró en Granada, del 12 al 16 de abril de 1999, el Congreso conmemorativo del 50 aniversario, que tuvo como sede el Auditorio de la Fundación Euro-Árabe de Altos Estudios. El Congreso estuvo organizado por la Universidad de Granada en coordinación con otras instituciones de Granada y Andalucía (Entre otras, la Caja General de Ahorros de Granada y la Fundación Fernando de los Ríos)

Diario El Ideal de Granada (suplemento especial, 11/4/99), El País [Andalucía] (14/4/99), revista Sistema (noviembre de 1999, números 152-153), BILE [Boletín de la Institución Libre de Enseñanza] (diciembre de 1999)

En la LVIII Feria del Libro de Madrid (mayo-junio de 1999) se presentaron dos de las ediciones previstas de publicación con motivo de la celebración del 50 aniversario. La Filosofía Política en Platón (facsímil de la tesis doctoral de Derecho defendida por Fernando de los Ríos en 1907, editada por la Fundación Fernando de los Ríos en diciembre de 1998) y Los Orígenes del Socialismo Moderno (facsímil del folleto editado originalmente en 1912, reeditado por la Fundación Fernando de los Ríos en mayo de 1999) fueron editados por la Fundación para su distribución en la citada Feria.

El 30 de mayo de 1999 se rindió en el Cementerio Civil de Madrid un íntimo y sencillo homenaje a Fernando de los Ríos, organizado por la Fundación que lleva su nombre. En el acto estuvieron presentes familiares del político homenajeado, militantes de PSOE y la UGT, así como destacadas personalidades del mundo de la cultura. Se procedió a colocar en la tumba de Fernando de los Ríos una corona de laurel, dirigiendo unas sentidas palabras doña Laura García Lorca y de los Ríos, nieta de don Fernando, y don Virgilio Zapatero Gómez, miembro del Patronato de la Fundación Fernando de los Ríos y presidente de la Comisión Organizadora del Cincuentenario.

La noticia del acto fue recogida en Noticias de la UGT (julio/agosto de 1999), revista El Socialista (julio/agosto de 1999), diario ABC (31/5/99) y BILE (diciembre de 1999).

El 31 de mayo tuvo lugar un coloquio radiofónico acerca de la obra y figura de Fernando de los Ríos, programado por la Fundación Fernando de los Ríos y con la colaboración de D. Pedro Altares para el programa La Radio de Julia, de Onda Cero. Participaron Dª Teresa Rodríguez de Lecea, D. Virgilio Zapatero Gómez y D. Santiago Carrillo, moderados por D. Pedro Altares

Organizado por la Universidad Internacional Menéndez Pelayo de Santander, en colaboración con la Fundación Fernando de los Ríos y bajo la Dirección de don Virgilio Zapatero Gómez, que actuó en calidad de patrono de la Fundación. Celebrado en la Universidad Internacional Menéndez Pelayo de Santander, del 4 al 6 de agosto de 1999.

El Diario Montañes (28/4/99, 23/4/99, 5/8/99, 6/8/99 y 7/8/99), Alerta -El Periódico de Cantabria- (28/4/99, 4/8/99, 5/8/99, 6/8/99 y 7/8/99), El Mundo (28/4/99 y 24/5/99), El País (28/4/99 y 24/5/99), ABC (28/4/99 y 24/5/99), La Vanguardia (28/4/99), El Periódico de Cataluña (28/4/99), El Correo Español del Pueblo Vasco (8/5/99) y El Norte de Castilla (8/5/99), BILE (diciembre de 1999)

Por iniciativa de la Fundación Fernando de los Ríos, y patrocinado por La Caja General de Ahorros de Granada, se organizó la exposición Fernando de los Ríos 1879-1949. Colaboraron un gran número de instituciones y personalidades, entre las que destacaron, de manera especial, el Ayuntamiento de Madrid, la Fundación Francisco Giner de los Ríos (ILE), la Fundación Pablo Iglesias y la Residencia de Estudiantes. En total, y aparte de la entidad organizadora (Fundación Fernando de los Ríos) y la institución patrocinadora (Caja General de Ahorros de Granada), fueron 47 las instituciones colaboradoras y 5 particulares, siendo 25, entre particulares e instituciones, las que cedieron documentos o piezas para su exhibición. 189 documentos y piezas fueron cedidos para la exposición. Asimismo, se editó un Catálogo que era fiel reflejo del material contenido de la exposición.

Dª Patricia Barbadillo Griñán actuó como Comisaria Ejecutiva de la Exposición y D. Virgilio Zapatero Gómez como Comisario de Honor. La exposición recorrió Granada y Madrid, del 16 de septiembre al 20 de octubre y del 4 de noviembre al 8 de diciembre de 1999 respectivamente. Las sedes de la exposición fueron el Centro Cultural "La General" en Granada y el Centro Cultural del "Conde Duque" en Madrid.

(Para una información más detallada de la Exposición puede consultarse el Informe Evaluativo sobre la misma realizado por la Fundación Fernando de los Ríos)

El País [Andalucía] (17/9/99), El País [Madrid] (5/11/99), ABC [Andalucía] (17/9/99), ABC [Madrid] (5/11/99), Diario 16 (5/11/99), La Razón (5/11/99), El Ideal de Granada (16/9/99, 29/9/99, 17/9/99, 18/9/99 y 19/9/99), El Correo de Andalucía (17/9/99), El Mundo (5/11/99), BILE (diciembre de 1999)

En el Centro Cultural del Conde Duque de Madrid, y simultáneas a la exposición, tuvieron lugar 3 mesas redondas sobre la figura, obra y el contexto histórico que vivió Fernando de los Ríos, organizadas por la Fundación Pablo Iglesias en colaboración con la Fundación Fernando de los Ríos. Los jueves 11, 18 y 25 de noviembre de 1999 a las 19,00 horas, tuvieron lugar las siguientes mesas: La Institución Libre de Enseñanza y sus políticos (moderada por Dª Mercedes Cabrera), Religión y Estado en la España del Siglo XX (moderada por D. Gregorio Peces Barba) y Las raíces del socialismo (moderada por D. Alfonso Guerra), días 11, 18 y 25 respectivamente.

El Ateneo Científico, Artístico y Literario de Madrid y la Fundación Fernando de los Ríos organizaron en las dos últimas semanas de noviembre un Ciclo de Conferencias sobre Fernando de los Ríos. Los días 23, 25 y 30 de noviembre de 1999, a las 19,30 horas se impartieron las conferencias La Cuestión Religiosa en Fernando de los Ríos, Semblanza y Vivencia y El Compromiso Político de un Institucionista, a cargo de D. Virgilio Zapatero Gómez, D. Santiago Carrillo y D. Octavio Ruíz-Manjón respectivamente. Conferencias presentadas por D. Luis Arrillaga y D. Francisco Ramos, que actuó como moderador y presentador de la conferencia pronunciada por D. Santiago Carrillo.

Del 21 al 25 de febrero de 2000 el Instituto de Enseñanza Secundaria "Fernando de los Ríos" de Málaga, en colaboración con la Fundación Fernando de los Ríos y otras entidades, rindió homenaje a Fernando de los Ríos con motivo del X aniversario de la fundación del instituto. La Fundación cedió sus documentos de archivo para la realización de la exposición que sobre Fernando de los Ríos organizó el Departamento de Lengua y Plástica del citado instituto. La documentación prestada estaba constituida por 30 copias fotográficas, 18 fotocopias en color de las ediciones de obras de Fernando de los Ríos, 3 facsímiles de prensa, copia de vídeo sobre la figura de don Fernando realizada por "Canal Sur", discurso de Fernando de los Ríos para el Archivo de la Palabra, Catálogo de la exposición "Fernando de los Ríos 1879-1949", trípticos y dípticos informativos sobre las actividades realizadas durante el 50 aniversario.